交通运输部于2017年5月23日发布了《交通运输部关于废止2件交通运输规章的决定》（交通运输部令2017年22号），废止《交通建设项目环境保护管理办法》（交通部令2003年第5号），自发布之日起施行。废止《交通建设项目环境保护管理办法》后，交通运输建设项目环境保护工作依据国务院2017年修订的《建设项目环境保护管理条例》相关规定进行管理。作为《交通建设项目环境保护管理办法》核心内容之一的交通建设项目环境影响评价行业预审工作，依据2016年修订的《环境影响评价法》予以取消。